Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms