Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MIS18AQ9NYP9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MIS18AQ9NYP9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MIS18AQ9NYP9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MIS18AQ9NYP9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MIS18AQ9NYP9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MIS18AQ9NYP9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MIS18AQ9NYP9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MIS18AQ9NYP9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MIS18AQ9NYP9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MIS18AQ9NYP9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MIS18AQ9NYP9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MIS18AQ9NYP9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MIS18AQ9NYP9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MIS18AQ9NYP9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MIS18AQ9NYP9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
MIS18AQ9NYP9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MIS18AQ9NYP9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms