Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms