Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP4R2Q9NY27 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms