Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L1Q9NU39 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms