Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
DEPPQ9NTK1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEPPQ9NTK1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEPPQ9NTK1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEPPQ9NTK1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPPQ9NTK1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPPQ9NTK1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPPQ9NTK1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPPQ9NTK1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPPQ9NTK1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPPQ9NTK1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms