Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRP7BPQ9NSQ0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms