Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms