Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms