Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELLSQ9NRZ9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms