Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms