Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NRIP3Q9NQ35 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms