Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4F12Q9HCS2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms