Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAS3Q9H6U6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms