Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms