Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms