Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms