Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J8

WDR33, pre-mRNA 3' end processing protein WDR33, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR33Q9C0J8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR33Q9C0J8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR33Q9C0J8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms