Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H9

SRCIN1, SRC kinase signaling inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCIN1Q9C0H9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCIN1Q9C0H9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms