Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms