Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC02407-202ENST00000553247 1083 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms