Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY49

PECR, Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PECRQ9BY49 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PECRQ9BY49 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PECRQ9BY49 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PECRQ9BY49 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PECRQ9BY49 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PECRQ9BY49 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PECRQ9BY49 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PECRQ9BY49 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms