Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSPO3Q9BXY4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms