Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
FANCD2Q9BXW9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
FANCD2Q9BXW9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms