Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms