Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms