Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM42Q9BTD8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM42Q9BTD8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms