Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
MTA3Q9BTC8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms