Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT17Q9BSW7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT17Q9BSW7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms