Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms