Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms