Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP88Q99567 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP88Q99567 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms