Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms