Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms