Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms