Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LCORQ96JN0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms