Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAMP1Q96JM3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAMP1Q96JM3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms