Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms