Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPNE2Q96FN4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms