Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EDC3Q96F86 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms