Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UTP4Q969X6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms