Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms