Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKD2Q969F2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NKD2Q969F2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms