Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms