Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNRQ92752 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNRQ92752 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TNRQ92752 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNRQ92752 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNRQ92752 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNRQ92752 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNRQ92752 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNRQ92752 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNRQ92752 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNRQ92752 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNRQ92752 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNRQ92752 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNRQ92752 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNRQ92752 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNRQ92752 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNRQ92752 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNRQ92752 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNRQ92752 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNRQ92752 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNRQ92752 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNRQ92752 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNRQ92752 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNRQ92752 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNRQ92752 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNRQ92752 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNRQ92752 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNRQ92752 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNRQ92752 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNRQ92752 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNRQ92752 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TNRQ92752 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TNRQ92752 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNRQ92752 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNRQ92752 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNRQ92752 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TNRQ92752 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNRQ92752 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNRQ92752 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TNRQ92752 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TNRQ92752 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
TNRQ92752 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TNRQ92752 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TNRQ92752 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TNRQ92752 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNRQ92752 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNRQ92752 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNRQ92752 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TNRQ92752 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNRQ92752 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNRQ92752 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNRQ92752 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNRQ92752 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNRQ92752 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNRQ92752 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNRQ92752 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNRQ92752 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNRQ92752 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNRQ92752 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNRQ92752 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TNRQ92752 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNRQ92752 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNRQ92752 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TNRQ92752 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNRQ92752 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNRQ92752 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNRQ92752 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNRQ92752 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNRQ92752 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNRQ92752 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNRQ92752 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNRQ92752 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNRQ92752 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNRQ92752 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNRQ92752 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNRQ92752 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNRQ92752 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNRQ92752 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNRQ92752 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNRQ92752 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNRQ92752 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNRQ92752 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNRQ92752 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TNRQ92752 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNRQ92752 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TNRQ92752 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNRQ92752 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNRQ92752 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNRQ92752 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNRQ92752 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRQ92752 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRQ92752 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRQ92752 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRQ92752 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRQ92752 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRQ92752 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRQ92752 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRQ92752 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRQ92752 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRQ92752 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms