Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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RABGGTAQ92696 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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