Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

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Length 791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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