Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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