Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM7

STAG1, Cohesin subunit SA-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG1Q8WVM7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
STAG1Q8WVM7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG1Q8WVM7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms