Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX29Q8TEQ0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms